Já tentou usar o framework Django em scripts de linha de comando?

Uma dica simples direto do StackOverflow resolve esse problema:

import os, sys

if __name__ == '__main__':
# Setup environ
sys.path.append(os.getcwd())
os.environ.setdefault("DJANGO_SETTINGS_MODULE", "main.settings")

# Setup django
import django django.setup()

Referências

Stackoverflow: https://stackoverflow.com/questions/32088702/using-django-for-cli-tool